鑽石舞台

早！今天和大家分享一篇今年9月發表在ADVANCED SCIENCE雜誌（IF:16.806）的文章《Identification and Characterization of Robust Hepatocellular Carcinoma Prognostic Subtypes Based on an Integrative Metabolite-Protein Interaction Network》，作者構建了綜合代謝物-蛋白質相互作用 (Metabolite-protein interactions，MPI) 網絡並開發了 MPI 預測模型，有助於重新定義可靠的肝細胞癌預後亞型。下面我們就來看看吧！

今天分享一篇2021年2月發表在NATURE COMMUNICATIONS的文章《Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat》，影響因子為14.919。理解細胞間的全球通信需要準確地表示細胞-細胞信號傳導聯繫，並對這些聯繫進行有效的系統級分析。作者構建了一個配體、受體及其輔助因子之間相互作用的數據庫，準確地代表了已知的異構分子複合體。然後開發了CellChat，一個能夠從單細胞RNA測序（scRNA-seq）數據中定量推斷和分析細胞間通訊網絡的工具。CellChat使用網絡分析和模式識別方法預測細胞的主要信號輸入和輸出以及這些細胞和信號如何協調功能。通過流形學習和定量對比，CellChat對信號通路進行分類，並在不同的數據集中劃分出保守的和特定環境的通路。將CellChat應用於小鼠和人類皮膚數據集顯示其有能力提取複雜的信號傳導模式。多功能和易於使用的工具包CellChat和基於網絡的資源管理器（http://www.cellchat.org/）將有助於發現新的細胞間通信，並在不同組織中建立細胞-細胞通信圖譜。