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●作者：李旭，天津信唐貨幣經紀有限責任公司交易總監

●本文系《金融市場研究》「砥礪十五載 奮進新征程」徵文來稿

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●作者：慈顏誼，中金公司投資銀行部固定收益組負責人、董事總經理

●本文系《金融市場研究》「砥礪十五載 奮進新征程」徵文來稿

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【做計算 找華算】理論計算助攻頂刊，10000+成功案例，全職海歸技術團隊、正版商業軟件版權！

催化反應中經常需要分析結構的靜電勢分布，其正確名稱叫做靜電勢在電子密度等值面上的分布。

本文以CHA三維八元環結構分子篩為例，為大家介紹靜電勢分布的計算及出圖方法。

1.導入CHA結構

首先在MS(Material Studio)軟件中右鍵Import在Examples/Documents/3D Model中導入CHA結構文件。

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2.改變CHA顯示方式

右鍵打開Displaystyle，單擊Polyhedron選項（結構顯示樣式不影響靜電勢的計算）

3.優化CHA結構，並計算靜電勢

1)打開Modules-DMol3-Calculation

2)Task設置為Geometry Optimization. Functional更改為LDA, VMN。

3)Electronic選項.k-point set設置為Gamma, Orbital cuttoff quality設置為Coarse。單擊More 按鈕。Orbital Cutoff選項卡中，設置orbital cutoff的值為3.5Å。（具體計算精度，根據需求來選擇）

4)在Properties中勾選Electron density和Electrostatics。

5)Job Control中選擇合適的核數，點擊run開始計算

4.處理靜電勢圖

1)在輸出的文件夾中打開CHA.xsd，之後右鍵打開Displaystyle，單擊Stick或Ball and stick選項，將CHA的顯示變成棍或球棍形式。

2)打開Modules-DMol3-Analysis：

l選中Electron density，並勾選View isosurface on import，然後單擊import；

l然後，選中Potentials，不勾選View isosurface on import，單擊import

3)等值面調整：

l右鍵打開Displaystyle，在Isosurface-Mapped field中選中DMol3 electrostatic potential；

lDisplaystyle-Isosurface-Transparency：調整透明度

lDisplaystyle-Isosurface-isovalue：調整等值面數值

4)右鍵打開Color Maps：

lFrom選擇MappedMinimum，To選擇MappedMaximum。

lSpectrum:調整配色方案

lBands:調整色帶

lColor Maps-Legend:修改圖例

5.繪製靜電勢切面圖

1)View-Toolbars-Volume Visualization，打開工具欄

2)從打開BestFit，打開Choose Fields to Slice對話框。選擇DMol3 electrostatic potential，單擊OK按鈕。

3)查看切面覆蓋的指定區域的最大值和最小值:單擊Color Maps按鈕,選擇切面。單擊From旁邊的右箭頭,選擇Mapped Minimum。單擊To旁邊的右箭頭,選擇Mapped Maximum。將Spectrum更改為Blue-White-Red。

4)單擊色條中的紅色右箭頭。所有大於平均值的點都被從切面上移除。單擊色條右側的||按鈕,重新顯示大於平均值的顏色。在Display Style對話框中的Slice選項卡中,調整Transparency，改變透明度。

點擊閱讀原文，提交計算需求！

MS楊站長團隊

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ScienceShare ｜ 科學私享

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