鑽石舞台

鹿鼠這玩意兒，

就這麼說吧，

它們就是整個北美洲數量最大的哺乳動物種群，沒有之一。

幾乎野外每個樹林子都有它們的蹤跡~

並且從名字都猜得到，

這貨和白尾鹿的棲息範圍高度重疊。

雖然還沒有直接觀察到鹿鼠感染白尾鹿的實錘，

但如果說有什麼中間宿主有可能協助白尾鹿衝擊罹患率八成的巔峰成績的話，

那麼鹿鼠一定是最佳種子選手。

而且吧，鹿鼠的數量和分布甩了白尾鹿八條街，

鹿鼠和人類的近距離接觸頻率更是甩了白尾鹿十八條街。

甚至早在新冠病毒面世之前，

鹿鼠就已經因為萊姆病、伯氏疏螺旋體和出血熱而臭名遠揚了……

而加拿大公衛署的這篇文獻，

算是提供了不少鹿鼠作為中間宿主的間接支撐證據。

簡而言之，加拿大公衛署發現，

北美鹿鼠對新冠病毒易感，

並且鹿鼠們的鼻拭子、咽拭子和直腸拭子都檢出了具有傳染性的活性病毒，

粑粑和尿液里也檢測到病毒RNA，

而且病毒載量巨高，

以至於不同老鼠之間，

可以通過近距離接觸而造成續發感染，

並形成穩定傳播鏈。

然後另外一個可能可以算是間接支撐證據的文獻則是來自國內，

作者是耳熟能詳的高福高老師（及團隊）。

——請品鑑：

簡單來說，

高福老師他們在南方三個地區，

採集了八個種類接近三百隻不同老鼠的咽拭子和肛拭子樣本。

其他35隻老鼠的樣本帶有某種冠狀病毒RNA。

高老師這篇論文研究的主題跟咱這篇文章關係不大，

所以暫時不深入介紹了。

咱需要而焦慮的地方在於這麼一個細節——

高老師他們這35份冠狀病毒陽性樣本裡面，

有34份是在某大型都市的客運車站和酒店採集到的，

而在人煙稀少的農村地區，

則千辛萬苦只採到了一份……

這個情況就說明了：

在人口密度大、人類活動頻繁的場景下，

鼠類感染和傳播冠狀病毒的風險更大。

結果一不留神就採到了驚天大瓜~

簡單來說就是，

作者們用了一些咱們不需要理解細節的黑科技，

可以測出污水樣品中病毒殘片刺突蛋白第412到579氨基酸位點的突變（RBD結構域就在這個範圍），

並且可以確認這些測出來突變點位是不是屬於同一個RNA序列。

因此作者們可以通過突變點位的排列組合，

進一步推算出污水樣品中各個變異株的占比。

然後根據以上原理，

作者們也真的在廢水裡測出了各種流行變異株，

比如alpha、beta、gamma和delta等，

並且跟紐約市感染者基因測序得到的流行率基本一致。

——詳見下圖：

↑ 上圖左邊是各個時間段感染者基因測序得到的各變異株占比，

右邊是對應時間段污水測序得到的各變異株占比。

不同色塊代表不同變異株（詳見右邊注釋框）

第一眼看上去挺正常對不對？

除了……

眼尖的朋友可能已經發現了：

污水測序組裡夾了一坨深藍色塊……

那一坨色塊，

代表的正是污水中的不明變異株（unknown waste-water lineage）。

本來，污水樣品裡邊有不明毒株倒也挺正常，

因為對污水採樣約等於是全局抽樣，

而相對地，紐約市確診感染者們並沒有100%做測序。

但作者們進一步發現了兩個疑點：

隨着紐約疫情好轉，確診人數日益減少，深藍色部分所占份額卻越來越多，並且從增加的比例來推論，這部分的絕對數量並不受紐約疫情曲線影響；

深藍色部分包含了四種聞所未聞的變異株

各位你們看不懂圖也沒關係，

你們不需要知道這四種變異株具體是啥。

你們只需要知道，

在預印本面世的那陣子，

人類所有測序數據庫的接近三百萬條測序記錄裡面，

完全找不到這四種，

連依稀相似的都沒有。

（直到2021年11月，Omicron橫空出世……）

然後作者們進一步發現，

這四個污水變異株唯一共同的突變點位——Q498H，這貨非常罕見。

截止2021年7月26日，

美國共有兩個含有Q498H的測序記錄。

（重說三）

然後呢，咱不妨再加一點料。

當時華中農業大學金梅林老師在柳葉刀上發表了一個研究結果~

——請品鑑：

Q498H突變是促進病毒感染老鼠的關鍵突變。

（重說三）

回到紐約下水道的這篇預印本~

作者們把紐約污水廠發現的四種神秘變異株放在慢病毒載體上

（順便拿D614G毒株做對比組），

分別用來跟表達了人ACE2、大鼠ACE2、小鼠ACE2以及不含ACE2的對照組做感染實驗。

——結果如下：

↑ 翻譯成人話：

上圖從左到右四組柱子分別代表：

沒有表達ACE2的對照組、

表達人ACE2的細胞系、

表達小鼠ACE2的細胞系，

以及表達大鼠ACE2的細胞系

然後各種不同顏色的柱子從左到右分別代表：

B.1株（D614G）、

alpha（A570D+N501Y）、

四種污水神秘毒株，

以及作為對照的慢病毒載體（neg）

最後，試驗結果：

B.1株（D614G）不能感染大鼠和小鼠；

污水中的四種神秘毒株非常容易感染大鼠和小鼠；

污水中的四種神秘毒株也非常容易感染人類。