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審校 小勺 訪冬

製版 阿金

生物學

Biology

Tumor necrosis factor induces pathogenic mitochondrial ROS in tuberculosis through reverse electron transport

腫瘤壞死因子通過反向電子傳遞誘導結核病中的致病性線粒體活性氧

(導讀 Brenda)腫瘤壞死因子(TNF)是一種重要的宿主的抗結核因子,而過量的TNF通過增加線粒體活性氧(mROS)產生易感性。本文研究確定了TNF誘導的mROS在結核中的分子機制。分枝桿菌感染的巨噬細胞中過量的TNF通過複合物I以反向電子傳遞(RET)方式提高mROS的生成。複合物I的抑制劑二甲雙胍可防止巨噬細胞壞死,可能在結核病治療中起到重要作用。[相關報道:Science|反向電子傳遞鏈「傳遞」致病性線粒體活性氧]

Twin peaks: The Omicron SARS-CoV-2 BA.1 and BA.2 epidemics in England

雙峰:英格蘭新冠病毒奧密克戎變異株BA.1 和 BA.2變體的流行

(導讀 阿金)本研究通過社區傳播實時評估-1(REACT-1)跟蹤了英國2020年5月至2022年3月5歲以上隨機選擇的受試者新冠病毒感染情況。2022年3月的加權流行率在REACT-1中達到了記錄頂峰——6.37%,奧密克戎變異株BA.2變體極大取代了BA.1變體。整體上流行率在增加,主要出現在65至74歲以及75歲以上人口中,這與增加的住院率和死亡情況相關。[論文詳細信息]

Fate mapping of neural stem cell niches reveals distinct origins of human cortical astrocytes

神經幹細胞生態位的命運映射揭示了人類皮質星形膠質細胞的不同起源

(導讀 一晴)人類新皮層發育的前體分別位於腦心室和室下外區(VZ和OSVZ)。然而,來自這些生態位的細胞是否遵循類似的發育命運尚不清楚。本研究證明來自這些小生境的星形膠質細胞在解剖結構上具有不同的層次:皮層板星形膠質細胞來源於VZ祖細胞並在局部增殖,而假定的白質星形膠質細胞在形態上是異質性的,來源於VZ和OSVZ祖細胞。研究確定了VZ來源的皮層板星形膠質細胞和OSVZ來源的白質星形膠質細胞之間的分子差異,強調了細胞譜系在人類新皮層星形膠質細胞多樣化中的複雜作用。[論文詳細信息]

A centimeter-long bacterium with DNA contained in metabolically active, membrane-bound organelles

一種厘米長的細菌,其 DNA 包含在代謝活躍的膜結合細胞器中

(導讀 一晴)大多數細菌種類的細胞長度約為2微米,一些較大的菌種可達750微米。念珠菌(Candidatus, Ca.) Thiomargarita magnifica是一種平均細胞長度大於9000微米的細菌,肉眼可見。這些細胞的生長比細菌細胞大小的理論極限高出多個數量級,攜帶一個非常大的基因組,超過50萬份的前所未有的多倍體,並經歷了染色體不對稱分離到子細胞的二態生命周期。這些特徵,以及基因組物質和核糖體在生物能量膜結合的翻譯活性細胞器中的劃分,表明這一菌譜系的複雜性,挑戰了細菌細胞的傳統概念。[論文詳細信息]

Diverse aging rates in ectothermic tetrapods provide insights for the evolution of aging and longevity

冷血四足動物的不同衰老速率為衰老和壽命演化提供新見解

(導讀 阿金)比較野生動物的死亡率是理解衰老演化的關鍵。本研究使用77個非禽類爬行動物和兩棲動物107個種群的數據,分析了野生冷血四足動物的衰老速率和壽命。在調控了系統發育和身體尺寸之後,發現冷血動物與恆溫動物相比,表現出更高的衰老速率多樣性。表型和生活史保護性策略進一步揭示了衰老的宏觀演化模式。因此在比較背景下分析冷血四足動物有助於提升對衰老演化的理解。[論文詳細信息]

Slow and negligible senescence among testudines challenges evolutionary theories of senescence

龜鱉類動物中緩慢而可忽略的衰老挑戰衰老的演化理論

(導讀 J.T.) 某些物種可能表現出緩慢甚至可忽略的衰老。針對生活在動物園和水族館的陸龜和海龜,研究表明,在52個物種中,約75%表現出緩慢或可忽略的衰老。約80%的物種,衰老速度低於人類。研究發現,體重與成年後的預期壽命正相關。與性別相關的身體大小二形性,可解釋壽命的性別差異。與人類和其他物種不同的是,海龜和陸龜可能因環境條件的改善而減緩衰老。[相關報道:千年王八萬年龜,它們為啥活得久?]

Small-molecule activation of OGG1 increases oxidative DNA damage repair by gaining a new function

小分子激活 OGG1可獲得新功能以促進DNA氧化損傷修復

(導讀 J.T.) OGG1可識別氧化性 DNA 損傷。OGG1切除 8-oxoG 並留下APE1底物,以啟動修復機制。本研究表明,小分子TH10785 與OGG1 的 Phe-319 和 Gly-42 相互作用,將酶活性提高 10 倍,並產生之前未被描述的 β,δ-裂解酶功能。TH10785 控制其分子結構內由氮鹼介導的催化活性。TH10785 可增加細胞中 OGG1的募集和對氧化性 DNA 損傷的修復。這使修復過程不再需要 APE1,而是依賴於多核苷酸激酶磷酸酶 (PNKP1) 的活性。研究結果可應用於疾病和衰老的治療。[論文詳細信息]

Structural basis for RNA-guided DNA cleavage by IscB-ωRNA and mechanistic comparison with Cas9

IscB-ωRNA切割RNA引導的DNA 的結構基礎及與 Cas9 機制的比較

(導讀 阿金)二型CRISPR效應子Cas9和Cas12演化自IS200/IS605轉座子核酶,而IscB只有Cas9的五分之二大小,共享相似的結構域組織。本研究報告IscB-ωRNA 結合dsDNA靶點的冷凍電鏡結構,揭示了IscB和Cas9核糖蛋白質之間的結構與機制相似性,並且在高分辨率解析度下解釋了相鄰基序識別,R環形成與DNA切割。ωRNA與Cas9內REC結構域擁有相似的功能,並與RNA-DNA異源雙鏈體相連接。[論文詳細信息]

8000-year doubling of Midwestern forest biomass

人口和生物群落規模的過程驅動中西部森林生物量在 8000 年內翻番

(導讀 岑寂)工業革命前陸地碳通量尚不清楚。本研究運用貝葉斯模型重現了美國中西部北部地區過去10000年森林生物量的變化,冰期後森林生物量在8000年間增長近乎一倍,與生物群落擴散及樹種組成改變密切相關。工業時代的肆意伐木和農業卻僅用兩個世紀就抹去了這一碳累積。[論文詳細信息]

化學

Chemistry

Catalyst-controlled site-selective methylene C–H lactonization of dicarboxylic acids

二羧酸催化劑控制的位點選擇性亞甲基 C-H 內酯化

(導讀 阿金)催化劑控制的自由羧基β-和γ-亞甲基C-H鍵的位點選擇性活化始終是挑戰。本研究把喹啉-吡啶酮配體與一對鈀催化劑組裝在一起,催化二羧酸實現高度位點選擇性的單內酯化反應,隨後通過位點選擇性β-或γ-亞甲基C-H活化,生成結構多樣且有合成價值的γ-和δ-內酯。研究人員由此通過充沛的二羧酸實現兩種天然產物——myrotheciumone A和pedicellosin的全合成。[論文詳細信息]

Nickel-catalyzed hydrogenative coupling of nitriles and amines for general amine synthesis

鎳催化腈和胺的氫化偶聯用於胺通用合成

(導讀 阿金)高效的胺合成方法仍然是化學工業的挑戰。本研究報告一種均相鎳催化劑,適用於一系列芳香族、雜芳香族、脂肪族腈與伯胺或仲胺的氫化交叉偶聯。該策略具有通用性,氪直接並高度選擇性地合成230種以上官能團化與結構多樣的胺,包括藥學相關和手性產物。[論文詳細信息]

地球科學

Geoscience

Rapid changes to global river suspended sediment flux by humans

人為導致的全球河流懸浮泥沙通量快速變化

(導讀 岑寂)人類過去半個世紀的活動對全球河流懸浮泥沙的含量和通量均產生了重大影響。本研究通過衛星技術分析了414條主要河流,發現在全球水文北方,大壩造成的沉積物截留導致河流懸浮泥沙通量下降了49%。土地利用變化導致全球水文南方河流侵蝕加劇,懸浮泥沙含量1980年代增長近41%。此種南北差異讓懸浮泥沙的主要源頭從亞洲轉移至了南美洲。[論文詳細信息]

Global ocean lipidomes show a universal relationship between temperature and lipid unsaturation

全球海洋脂質組顯示溫度與脂質不飽和度之間的普遍聯繫

(導讀 阿金)使用「組學」技術展開全球規模調查浮游生物群落改變了我們對海洋的理解。本研究運用高分辨率精確質譜分析工作流程分析了930份全球海洋脂質樣本,揭示了先前未知的海洋浮游生物脂質組特徵,識別出1151種不同脂類,發現脂肪酸不飽和主要受到溫度限制。因此預測在下一個世紀海洋必需脂肪酸二十碳五烯酸會大幅度下降,可能對漁業產生嚴重影響。[論文詳細信息]

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