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小編在過去的很長一段時間為大家介紹了許多細胞死亡領域的熱點,包括鐵死亡、細胞焦亡、壞死性凋亡等等,甚至包括前幾周刷爆全網的銅死亡。可能有小夥伴比較疑惑,小編到底從哪搞到這些東西的。今天小編也不藏着掖着了,直接把壓箱底的寶貝分享給大家,也就是細胞死亡命名委員會(NCCD)在2018年的建議。NCCD在2018年明確定義了十二種調節性細胞死亡。

免疫原性細胞死亡相關思路

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從圖中,我們可以看到一些熟悉的身影,比如前兩年火爆的鐵死亡和細胞焦亡。不過小編今天要為大家推薦的熱點是免疫原性細胞死亡(immunogenic cell death, ICD)。

為什麼關注免疫原性細胞死亡(ICD)

目前免疫原性細胞死亡已經成為標準腫瘤學詞彙的一部分,促進了新治療劑、治療組合和個性化策略的開發。其實早在2013年,科學家們就從癌症治療的角度,討論了ICD的特徵、潛在的細胞生物學、免疫效應細胞感知ICD的通路,以及ICD對人類病理生理學的潛在影響。期望未來ICD的概念能夠幫助開發高效的治療方案。

時隔多年,終於有兩種基於ICD定義的抗癌藥物問世了。其中一個是2020年FDA批准的belantamab mafodotin,用於治療復發或者難治性多發性骨髓瘤的成人患者;另一個是FDA批准的lurbinectedin,用於治療小細胞肺癌。

除此之外,ICD能成為熱點,還因為今年四月份NATURE IMMUNOLOGY再次強調了ICD在免疫監視中的關鍵作用。而且,數百個正在進行測試的臨床實驗表明在ICD誘導化療後,腫瘤會從「冷」變「熱」,從而對免疫檢查點抑制劑有反應。

當然了,如果ICD已經發表了大量文章,我們再想入手也容易撞車。所以小編檢索了大量的文獻,發現目前只有兩篇純生信的文章。一篇是來自2015年的大規模meta分析,探索了免疫原性細胞死亡基因的預後潛能;一篇是來自去年的頭頸鱗狀細胞癌基於免疫原性細胞死亡的分子分型的文章。從結果來看,ICD方向留給了我們巨大的空間。

如果我們想研究ICD,還有哪些方向可以做呢?小編從生信的角度簡單為大家總結幾個思路來練練手。

思路一、ICD相關signature

完全可以和鐵死亡或者細胞焦亡一致,基礎的思路就是基於這個基因集合進行篩選,並且構建一個signature。不到兩個月就能輕鬆做出一個3-5水平的結果。

思路二、ICD相關疾病分型

同樣的,我們完全可以參考鐵死亡的研究框架,而且前面我們提到,ICD目前已發表的文章中就有這麼一篇。在為大家介紹銅死亡的時候,小編還提到,關於鐵死亡和細胞焦亡的分子分型的思路,同一個雜誌接收了這類文章。所以換個死亡方式是完全可行的。

思路三、單細胞數據出發或者單細胞聯合bulk RNA數據

關於這一點,小編在介紹銅死亡的時候,其實也分享過類似的框架。單純的單細胞數據挖掘或者聯合bulk RNA數據,能夠輕鬆做到6-7的水平。只不過與前兩個比起來,分析難度提升了不少。

免疫原性細胞死亡(ICD)分子機制

免疫原性細胞死亡是什麼?其實免疫原性細胞死亡是調節性細胞死亡的一種,一種足以在具有免疫能力的宿主中激活適應性免疫的細胞死亡方式。在2005年,免疫原性細胞死亡概念被引入,用以區分驅動抗原特異性免疫反應並最終導致免疫記憶的RCD與僅參與固有免疫機制(通常是壞死)和引起主動免疫抑制的RCD(通常是凋亡)。垂死的哺乳動物細胞會發出許多與宿主相互作用的信號,以決定細胞應激和死亡的免疫學相關性。在沒有反應性抗原決定簇的情況下,這些信號可能會驅動炎症,但不能參與適應性免疫。相反,當細胞表現出足夠的抗原性時,例如在感染或者惡性細胞的情況下,它們的死亡可能會導致由細胞毒性T細胞執行並引發免疫記憶的適應性免疫反應。

ICD可由一組有限的刺激引起,包括病毒感染、一些FDA批准的藥物(蒽環類藥物等)、特定形式的放療和光動力治療。這些情況會時危險相關分子模式(DAMP)的及時釋放,免疫系統固有和適應性免疫組分表達的PRR會識別DAMP,警告機體有危險的情況,導致引發通常與免疫記憶建立有關的免疫反應。

目前,已經有6種DAMP與RCD作為免疫原性的感知機制有關:

Calreticulin (CALR) 鈣網蛋白,ATP, High-mobility group 1, Type 1 IFN, Cancer cell-derived nucleic acid, Annexin A1。不過其中HMGB1和ANXA1在ICD的背景下的分子機制還有待闡明。

總結

細胞死亡領域不僅僅只有我們所熟知的鐵死亡、細胞焦亡。其實細胞焦亡剛出來的時候,也不是什麼熱點。小編為大家分享細胞焦亡的時候,綜合了多個層面的證據,表明了細胞焦亡隨後肯定是熱點,事實也證明小編沒有說謊。今天為大家介紹的免疫原性細胞死亡,相信大家也看到了它的重要性和研究潛力,可別等文章都爛大街了,才反應過來這是個熱點。

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