生信人 - 11+腫瘤免疫分型純生信分析－鑽石舞台

今天給大家分享9.2號在BIB（IF：11.6）雜誌發表的一篇關於通過篩選腫瘤和非腫瘤樣本間活性發生改變的基因集來對肝癌進行分型的文章，思路清晰，內容豐富，值得學習。

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流程圖：

結果：

1、計算樣本免疫、hallmark基因集GSVA得分

2、Cox回歸篩選預後相關gene sets對疾病進行NMF聚類識別肝癌亞型及（聚類、PCA可視化、聚類生存差異）及數據集驗證

3、肝癌亞型及關聯臨床特徵分析

4、Lasso回歸篩選預後基因集

5、預後相關gene sets 富集分析

6、預後相關gene sets PPI 互作網絡構建

這樣11分就到手了，是不是不難。但是原文故事說的好，發現結果中的一些規律聯繫上下，展開描述。很多時候好文章並不是算法多麼複雜，根據結果講好故事也是很重要的。

對該思路感興趣的話

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