生信之家 - 【4月30日-5月1日】腫瘤免疫與新型細胞死亡課題設計及生信分析培訓班－鑽石舞台

腫瘤免疫與新型細胞死亡課題設計及生信分析培訓2022.4.30-5.1

醫藥加騰訊會議

通過近幾年的國自然項目以及文獻發表來看，腫瘤微環境和新型細胞死亡方向的研究非常熱門。無論是國自然資助的數量和金額，還是Pubmed發表的文獻都是逐年增加的趨勢。

腫瘤微環境（Tumor microenvironment，TME）是由腫瘤細胞、宿主細胞（基質細胞和免疫細胞）、以及相應細胞的分泌產物和細胞外基質（ECM）組成，同時也可能存在TME的代謝產物和特定的環境。腫瘤微環境是腫瘤賴以生存的「土壤」。腫瘤的生長與轉移與周圍環境息息相關，腫瘤可以通過釋放細胞信號分子影響其微環境環境，促進腫瘤的血管生成和誘導免疫耐受，而微環境中的免疫細胞可影響癌細胞增長和發育。

通過發揮促腫瘤作用和抗腫瘤作用，浸潤腫瘤的免疫細胞可以深刻影響腫瘤的進展以及抗癌治療的成功。因此免疫細胞浸潤是非常重要的研究方向，我們的科研人員開發了很多實用的分析數據庫和分析工具。

在細胞死亡方面，除了大家耳熟能詳的細胞凋亡、壞死性凋亡（necroptosis）、自噬外，一些新型細胞死亡方式的研究成為國自然的重要支持方向，包括細胞焦亡和鐵死亡等。

細胞焦亡（Pyroptosis）又稱細胞炎性壞死，是一種程序性細胞死亡，表現為細胞不斷脹大直至細胞膜破裂，導致細胞內容物的釋放進而激活強烈的炎症反應。細胞焦亡是機體一種重要的天然免疫反應，在抗擊感染和激活腫瘤免疫微環境方面發揮重要作用。細胞焦亡是由gasdermin介導的細胞程序性壞死。

鐵死亡(Ferroptosis)是一種鐵依賴性的調節性細胞死亡方式。鐵死亡的過程很複雜，由多種代謝物和生物分子組成，其中驅動基因、抑制基因、誘導因子和抑制因子是鐵死亡的調控因子。鐵死亡的核心標誌是ROS激活的質膜脂質過氧化。

示例圖鐵死亡相關腫瘤微環境免疫細胞

示例圖腫瘤免疫微環境

示例圖細胞死亡對腫瘤免疫的影響

示例圖免疫細胞浸潤分析

示例圖表達與預後關聯

怎樣基於自己的測序數據或公共數據庫的數據（比如TCGA、GEO、EBI等）進行免疫細胞浸潤分析或新型細胞死亡相關分析，常用的分析數據庫以及分析工具的使用過程實操及結果解讀是怎樣的？我們擬於x月x日向感興趣的學員重磅推出新一期相關培訓。

培訓目標：

1.掌握在腫瘤發生過程中固有和適應性免疫的重塑特點。

2.詳細了解腫瘤免疫逃逸的分子過程和分子機制。

3.理解新型細胞死亡特點及其在腫瘤免疫微環境重塑中的作用。

4.通過實例學習並掌握TIME課題設計思路和研究策略

5.了解最新最熱癌症分析思路，免疫細胞浸潤及鐵死亡分析參與過程。

6.免疫細胞浸潤相關數據庫及工具學習（TIMER2.0, CIBERSORT, IMMUPORT, xCELL等）

7.鐵死亡相關數據庫及工具學習（FerrDb，KEGG）

8.國自然及高分文獻中免疫細胞浸潤及鐵死亡分析相關圖表生成製作。

講師介紹：

M教授，北京大學博士，斯坦福大學博士後，歐盟Erasmus+訪問學者。教授，博士生導師。主要從事腫瘤分子生物學，藥理學等研究，在相關領域取得了令人矚目的成就。在Blood、Cancer Research、Oncogene、Journal of Clinical Investigation、Journal ofBiological Chemistry等著名雜誌已發表研究論文60多篇，IF>400。主持重點國合等項目。評審重點、重點國合、優青、傑青等不同類型項目，經驗豐富。

宋偉博士，中國精準醫療學會委員。

成果：參與完成了近百篇軟件著作權和發明專利的撰寫和申請；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建；完成個體基因檢測流程和無創唐篩流程的開發。

研究方向：有近十年的生信分析經驗，擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預後與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等，精通perl、R等編程語言。

培訓經歷：在北京、上海、廣州、瀋陽、成都、武漢等城市舉辦過十幾場培訓班。培訓的對象有：醫生、學生、科研工作者、生信愛好者等。

培訓方向：《測序與芯片數據分析》、《生物信息學的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關係》、《生信與臨床醫學的關係》、《生信實用工具培訓》、《多組學整合分析流程》、《R語言培訓》等。

會議安排：