早!今天小編和大家分享一篇2021年10月發表在J Inflamm Res雜誌(IF:4.631)的文章《Crosstalk between Circulatory Microenvironment and Vascular Endothelial Cells in Acute Myocardial Infarction》。在這篇文章中,作者從急性心梗(AMI)患者的 3 種類型的血管內細胞(血小板、內皮細胞、單核細胞)和外周血中提取了上調錶達的表面受體、細胞外基質和分泌蛋白,預測了它們的串擾。隨後,探索了來自血小板的miRNA分別作用於單核細胞和內皮細胞的樞軸的方式。最後,確定了 miRNA 與細胞內潛在機制之間的細胞間串擾,以構建 AMI 中細胞間相互作用的綜合調控景觀。下面我們就一起來看看吧!
1
背景&方法
急性心肌梗死 (AMI) 是世界範圍內死亡的主要原因,在臨床上,經皮冠狀動脈介入治療(PCI)常用於AMI患者的治療,但對AMI病理無能為力。所以即使在最好的PCI治療下,心肌梗死面積大的AMI患者也無法治癒,最終發展為心力衰竭。因此,迫切需要對病理有影響的新療法。目前,缺乏對AMI的細胞分子機制的探索。因此,作者探索了細胞間的串擾,以及其介導AMI的潛在分子機制。
方法:
1.數據的獲得:外泌體數據來源於自己測序。此外,從GEO數據庫獲得AMI患者的外周血單個核細胞、血小板和內皮基因表達譜;
2.分別篩選3種血管內細胞和外周血的差異基因(DEGs);
3.對DEGs進行GO 和KEGG富集分析;
4.提取3種血管內細胞和外周血表面受體、分泌蛋白和細胞外基質上調的DEGs,分析他們的表達並探討了串擾基因之間的相互作用和串擾基因與通路基因之間的關係;
5.對受體和配體基因進行分子對接;
6.功能相似性分析篩選關鍵基因。

2
研究結果
心肌梗死患者分子表達障礙圖譜
分別從不同種類樣本篩選差異基因,血小板樣本中有1738個DEGs, 內皮細胞中有2601個DEGs,外周血單個核細胞中有10678個DEGs,外周血中有743個DEGs。共有11個DEGs是共有的,這11個DEGs的表達趨勢在不同種類樣本中是不同的。


DEGs介導的功能和通路功能障礙
分別對幾種樣本的DEGs進行GO和KEGG富集分析。AMI樣本中「磷脂酰肌醇去磷酸化」、「肌管分化正調節」、「葡萄糖代謝過程」和「慢性炎症反應」顯著富集。


心肌梗死中循環微環境與血管內皮細胞的相互作用
從差異表達的上調基因中提取了表面受體、細胞外基質和分泌蛋白。3種血管內細胞與外周血通過這些蛋白的相互作用存在明顯的串擾,其中單核細胞與內皮細胞表面受體的相互作用最強。

細胞間相互作用介導的機制障礙的綜合景觀
串擾基因與細胞通路基因之間存在顯著相關性。因此,構建了靶向介質介導的AMI潛在機制網絡。同時,根據外泌體lncRNA與串擾基因的相互作用,構建了外泌體lncRNA參與AMI的潛在機制網絡。


功能失調的綜合景觀的樞紐基因可用作AMI的生物標誌物
篩選出 8 個介導基因,包括 MYD88、IL1B、TYK2、RELA、TNF、NFKB2、MAPK11 和 IL10。其中,RELA、TNF和IL10是3種血管內細胞與外周血之間串擾的關鍵基因,最有可能成為AMI的潛在標誌物。



微信號|中科生信
提供「一站式」科研定製服務