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編輯：Schnappi
來源：紐約時報
編譯：Seven
去年1月，一組在紐約市廢水中尋找冠狀病毒的研究人員在他們的樣本中發現了一些奇怪的東西：一種具有獨特的突變群的病毒，且該樣本以前從未在人類患者中發現過，這是一種從未被發現的變體。
昆士伯勒社區學院（Queensborough Community College）的微生物學家莫妮卡·特魯希略（Monica Trujillo）從含有冠狀病毒的廢水樣本中過濾出細菌。
報道稱，在過去的一年裡，科學家們一直在尋找出現在城市廢水中的奇怪冠狀病毒序列的來源。在這段時間裡，科學家們所說的「神秘血統」持續在城市的廢水中出現。
研究人員的研究結果於2月3日（周四）發表在《自然通訊》上，沒有證據表明這些已經傳播了至少一年而沒有超過Delta或Omicron的變種對人類的健康構成了更高的風險，但仍然不知道它們來自哪裡。
研究人員們對這些樣本的起源感到困惑。一些人傾向於解釋這種病毒來自那些感染沒有被測序捕獲的人。但其他人懷疑這些譜系可能來自感染病毒的動物，可能是紐約市大量的老鼠。即便如此，不同的理論也可能每天或每小時都在變化。答案仍然難以捉摸。
皇后學院的病毒學家約翰·丹尼希（John Dennehy）說：「我認為找到源頭非常重要，但我們一直無法確定這一點。」
皇后學院約翰·丹尼希實驗室的過濾後的廢水樣本。
奇怪的序列
自2020年6月以來，研究人員一直在對紐約市14個處理廠的廢水進行採樣。2021年1月，他們開始對樣本進行有針對性的測序，重點關注病毒最重要的刺突蛋白的部分基因。儘管這種方法對病毒基因組的了解有限，但它允許研究人員從廢水中提取大量數據，其中病毒通常是碎片化的。
紐約市健康和心理衛生局發言人表示，到目前為止，還沒有在紐約市的臨床病人中看到這些變種。
研究人員發現，具有新突變模式的病毒片段在少數處理廠反覆出現。加州大學伯克利分校的研究人員在加州的一個下水道中發現了類似的序列。
科學家們在對找出樣本來自何處做着努力，突出了廢水監測的潛力，這可以幫助科學家密切關注病毒的演變。
這些病毒可能來自於那些沒有被檢測到的感染者，或者他們的病毒還沒有被測序。但是，研究人員說，考慮到紐約人和他們可能攜帶的任何變種往往不受限制地在整個城市流動，他們不斷在同樣的幾個污水處理廠出現的事實使得這種理論不太可能。
儘管如此，丹尼希博士推測，這些序列可能來自於城市中僅有的幾個地區的長期醫療機構中的人。但他還沒能證明這一點。
的確，免疫系統受損的人可能更難抵禦病毒，讓病毒有更多機會變異。許多科學家推測，Omicron就是從免疫力低下的病人身上出現的。
耐人尋味的是，這些「神秘血統」有一些與Omicron相同的突變，或在相同的位置有突變。實驗室的實驗表明，這些病毒也可能能夠逃避一些抗體。
另一方面，一些科學家認為，這些譜系已經流通了足夠長的時間，以至於它們應該出現在至少一個被感染者的測序樣本中。
密蘇里州病毒學家約翰遜（Johnson）博士表示，他贊成序列來自動物的假設，也許是一些領土有限的特定種群。2021年5月和6月，當紐約市的人類新冠病例數量較少時，神秘的譜系在廢水中的病毒RNA中占更大比例，這表明它們可能並非來自於人類。
密蘇里大學的病毒學家約翰遜將廢水樣本裝入離心機。
研究人員最初考慮了各種各樣的潛在宿主，從松鼠到臭鼬。「這是一種非常雜亂的病毒，」約翰遜博士說。「它可以感染各種物種。」科學家們發現，雖然水中的絕大多數遺傳物質來自人類，但也存在少量來自狗、貓和老鼠的RNA。
老鼠一直是約翰遜博士的重點考慮對象，這座城市裡遊蕩着數以百萬計的老鼠。在他的實驗室里，他創造了假病毒，一種無害的、不可複製的病毒並與神秘序列存在相同的突變。他發現，假病毒能夠感染小鼠和大鼠細胞。該病毒的原始版本似乎無法感染齧齒動物，儘管其他一些像Beta的變種可以。
據報道，自去年夏天以來，科學家們一直在與美國農業部的動植物衛生檢驗局合作，在當地老鼠的血液和糞便樣本中尋找病毒的跡象。然而到目前為止，他們一無所獲。
鑑於人類可以將病毒傳染給動物，尤其是寵物以及他們經常接觸的其他動物，科學家們擔心，該病毒可能會在動物宿主中發生變異並傳回給人類。
科學家表示，目前沒有任何證據表明該病毒正在野生老鼠中傳播。人類感染老鼠的途徑也是未知的。
為了弄清病毒起源，約翰遜博士開發了一種新技術，可以僅擴增非Omicron序列，這應該更容易檢測譜系。他還開始在其他州的污水樣本中尋找類似的譜系，這可能有助於為它們的起源提供進一步的線索。
約翰遜博士說：「我們最終會知道。」
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