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大家好,
之前預告過,
咱過完元旦要八卦B.1.640,
結果沒曾想到,
身為屢教不改的搶跑犯,
咱居然也有被別人搶跑的一天……
氣氛頓時有些尷尬……

——請品鑑:


不過很可惜,
這些搶跑的吧,
一開始就沒選對信源,
又不肯花點功夫做fact check,
所以毫無懸念,
被坑爹的信源帶溝里了……

所以還是讓咱來重頭搶跑一次吧,
順便做一做短文改錯得了

簡而言之,
大多數中文版消息的信源,
都是下面這個預印本~

——請品鑑:


標題:
一種擁有刺突蛋白E484K和N501Y突變的新冠病毒變異株

看起來還挺像模像樣的是吧?

而且作者們所屬機構也是正兒八經的教學醫院、公立研究型大學和基因組測序實驗室~

簡直讓人莫名安心~

安心就對了,

因為其實這篇預印本吧,

乾貨方面大致是沒問題的,

(基本沒啥乾貨)

所以前幾天咱也借用了裡面的一張圖來着,

總之,

這篇預印本的問題主要出在……

愛夾帶私貨的通訊作者身上~

——請品鑑:

……

……

所以各位不妨猜一猜,

這位自稱出身自IHU地中海傳染病研究所兼艾克斯-馬賽大學的Didier Raoult老師,

為啥通訊郵箱留了個gmail……

是不是一股貓膩的感覺撲面而來

其實吧,

經常關注外網疫情信息的朋友可能已經想起來了,

這位Raoult老師,

他不是一般人,

他早在2020年初就火出了圈~

《紐時》(以及其他很多主媒)曾經專門為他浪費不少篇幅,

——請品鑑:

翻譯成人話:
他曾是科學明顯,
後來卻開始販賣一種有問題的新冠神藥
特總背後的辣個男人……
為了推銷某種未經證實的藥物而瘋狂攀咬各路大佬……
其聲稱的100%療效震驚了全體科學界

看完《紐時》這個標題,

各位想必回憶起來了吧?

這位老帥鍋Raoult老師,

就是當初全世界高調強推羥氯喹的那位奇葩

曾經靠着三寸不爛之舌贏得廣大非洲國家頂禮膜拜,

又隨着神藥羥氯喹的拉胯而徹底淪為笑話

現如今這位大師突然重出江湖,

高調充當通訊作者,

各大媒體搬運之前,

難道不瞅一眼原文的嗎……

至於這篇預印本,

本身倒是沒啥大的硬傷,

因為信息量特別少,

想搞些硬傷出來都難……

簡單口述兩句吧~

Raoult老師他們發現,

11月中旬的時候,

在法國南部的普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,

有一位剛剛從喀麥隆旅行回法國的確診病例,

PCR檢測結果有蹊蹺~

這裡插播一條小知識,

法國人在搞測序之前,

經常習慣通過特殊設計的PCR檢測機制來預先確定感染者攜帶的毒株是否帶有L452R、E484K、E484Q、N501Y和P681H這五個特定突變。

原因在於,通過上述五個突變的排列組合,

其實可以大致推算出毒株……

比如L452R陽性+其他陰性≈Delta;

E484K陽性+N501Y陽性+其他陰性≈Beta(因為法國幾乎沒有Gamma和Mu);

N501Y陽性+P681H陽性+其他陰性≈Alpha;

等等等等。

但這位喀麥隆病人吧,

他的PCR初篩的結果特別奇葩,

居然是E484K陽性+N501Y陽性+P681H陽性,

這是之前從來沒出現過的情況~

(又是因為法國沒Gamma和Mu)

既然碰到了新鮮玩意兒,

那可必須得做測序了,

於是相關部門安排這位病例去Raoult老師他們醫院,

測完序之後發現這玩意兒造型驚人,

又順着感染鏈測了十來例,

結果擼出來了一串……

總之情況就是這麼個情況,

Raoult老師他們測完序之後,

用淺顯易懂的蹩腳法式英語把這玩意兒簡單描述了一下,

最終湊成了這篇預印本。

統共就這麼一丟丟信息量,

想犯什麼大錯誤都無從下手……

但是吧,這並不等於這玩意兒沒問題,

相反,它充滿了小問題……

或者說,充滿了私貨……

比如說:

首先,

這玩意兒的發現者,

根本就不是Raoult老師,

而是本公眾號的老朋友,

Pango team旗下頭號變異株神探,

帝國理工學院Peacock老師~

(又是這逼……)

——請品鑑啊:

↑ Peacock老師早在12月4日就提交命名申請了

然後,法國的第一例病例也並不是11月中旬出現在南法,

而是10月25日現身於法蘭西島~

(根據內線爆料,是巴黎奧利機場附近)

——請品鑑:

最後,這玩意兒的源頭更不是啥喀麥隆,

而是剛果或者剛果金二選一~

具體來說,

Peacock老師私底下一遍一遍擼演化樹,

最後擼出來的推論大概是這樣的:

鑑於B.1.640跟C.1.2(以及C.38)在刺突蛋白明顯的相似性,

又鑑於B.1.640和C.1.2都有(類似於Omicron那種)多重重組的痕跡,

然後我們已經知道C.1.2和C.38的共同祖先在剛果金,

所以B.1.640的起源地更有可能是剛果金。

——B.1.640.2和C.1.2在刺突蛋白的相似程度,請品鑑:

P9+R190+D215+Y449+E484+N501+P681+T859+D936整整九個,

其中P9、R190、Y449和D936還都是相對比較罕見的突變位點~

當然了,還有一些學術禮儀和措辭方面的小問題,

比如用了GISAID的東西去不給credit,

再比如掰着手指數缺失突變的數量卻輸錯了……

等等

但礙於篇幅,就不提了罷。

下面進入喜聞樂見的販賣焦慮環節了啊。

首先,強調一句,

鑑於Raoult老師人品堪憂,

咱就暫時不採信他們所謂的67人確診後全部入院的口徑了~

但其實吧,

除了Raoult老師的預印本之外,

法國官方也簡單提到過關於B.1.640的數據~

只不過沒嚴格區別B.1.640.1和.2而已。

(所以需要假定B.1.640家族兩個子毒株的毒力差不多)

——請品鑑:

↑ 以上是法國衛生部2021年12月15日的變異株情況例行更新

高亮部分翻譯成人話:

- 截止2021年12月13日,123名確診病例的完全接種率為68%;

- 同期法國完全接種率為70%……

- 123人當中有10人入院,其中兩人需機械通氣;

- 同期法國總體入院率約為2.6%左右(以入院滯後7天計);

- 上法蘭西大區某院感事件,26例感染者裡面有11例是B.1.640,其中3例死亡……

- 諾曼底某餐廳聚集性爆發事件,參與者100%接種,101人當中感染57人,入院3人……

總結總結啊,

根據上述(小樣本量)官方數據,

(重申一下,樣本量很小……)

我們可以粗略地得出以下推論:

70%的全民接種率,68%感染者接種過疫苗……這個防感染保護效力≈0;

B.1.640的CHR(確診病例入院率)比同期整體水平高了三倍出頭;

某院感事件的病死率3/11≈27%;

某聚集性感染罹患率57/101≈56%;(100%完全接種)

上述聚集性感染的CHR≈5.3%(100%完全接種)

總結完畢,

順便重複第三遍:

以上樣本量太小,

且口算很糙,

還沒能排除混雜因素……

所以上述數據給各位做個參考還行,

但可能經不起細究~

請各位考據黨手下留情……

另一個問題在於,

在這貨的重災區,

也就是這篇預印本所說的普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,

存在一些細微的異常~

——比如說,請先品鑑:

↑ 上面左圖是全法國的新增確診人數,

右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的新增確診人數。

兩邊幾乎一毛一樣。

——可是呢,請繼續品鑑:

↑ 上面左圖是全法國的入院人數,

右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的入院人數,

明顯右邊要更抖一丟丟……

而且這一點似乎沒法用接種率的細微差異來解釋~

(法國全國成人接種率91%這樣,普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區則是86%左右)

——還沒完呢,請再品鑑:

↑ 上面左圖是全法國的危重病例,

右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的危重病例。

——最後,死亡人數:

所以到底是為了啥呢?

然後,更值得焦慮之處,

也許是這貨的傳播速度~

話說現如今大伙兒可能被Omicron抬高了焦慮門檻~

但其實就在短短兩三個月之前,

某個變異株值不值得關注,

唯一的判定標準就是它能不能不被Delta干滅絕……

而B.1.640是當初唯二能頂着Delta霸榜的巨大優勢實現逆勢增長的怪物……

(另一個怪物則是跟B.1.640長相差不多的C.1.2)

——請品鑑:

↑ 在普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,B.1.640相對於全局的相對增長優勢高達34%。

而就算Omicron開始在法國急速飆升之後,

B.1.640居然還沒被擠掉……

——請再品鑑:

↑ 紫色的曲線就是正在暗搓搓刷市占率的B.1.640家族~

最後總結一嘴吧。

B.1.640從誕生開始,就被ECDC、UKHSA和WHO選入VUM(監視中的變異株)清單,

這顯然不是沒原因的……

這貨在傳播效率和免疫逃逸方面可能不如Omicron,

但也已經初步展示出足以推翻Delta的實力了~

所以啊,

哪怕Omicron沒有出現,

Delta似乎還是沒法永遠一桶漿糊~

攤手~

又及,說起來,

廣袤非洲真是充滿了無限可能啊……

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