

看起來還挺像模像樣的是吧?
而且作者們所屬機構也是正兒八經的教學醫院、公立研究型大學和基因組測序實驗室~
簡直讓人莫名安心~
安心就對了,
因為其實這篇預印本吧,
乾貨方面大致是沒問題的,
(基本沒啥乾貨)
所以前幾天咱也借用了裡面的一張圖來着,
總之,
這篇預印本的問題主要出在……
愛夾帶私貨的通訊作者身上~
——請品鑑:
……
……
所以各位不妨猜一猜,
這位自稱出身自IHU地中海傳染病研究所兼艾克斯-馬賽大學的Didier Raoult老師,
為啥通訊郵箱留了個gmail……
是不是一股貓膩的感覺撲面而來
其實吧,
經常關注外網疫情信息的朋友可能已經想起來了,
這位Raoult老師,
他不是一般人,
他早在2020年初就火出了圈~
《紐時》(以及其他很多主媒)曾經專門為他浪費不少篇幅,
——請品鑑:
看完《紐時》這個標題,
各位想必回憶起來了吧?
這位老帥鍋Raoult老師,
就是當初全世界高調強推羥氯喹的那位奇葩,
曾經靠着三寸不爛之舌贏得廣大非洲國家頂禮膜拜,
又隨着神藥羥氯喹的拉胯而徹底淪為笑話
現如今這位大師突然重出江湖,
高調充當通訊作者,
各大媒體搬運之前,
難道不瞅一眼原文的嗎……
至於這篇預印本,
本身倒是沒啥大的硬傷,
因為信息量特別少,
想搞些硬傷出來都難……
簡單口述兩句吧~
Raoult老師他們發現,
11月中旬的時候,
在法國南部的普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,
有一位剛剛從喀麥隆旅行回法國的確診病例,
PCR檢測結果有蹊蹺~
這裡插播一條小知識,
法國人在搞測序之前,
經常習慣通過特殊設計的PCR檢測機制來預先確定感染者攜帶的毒株是否帶有L452R、E484K、E484Q、N501Y和P681H這五個特定突變。
原因在於,通過上述五個突變的排列組合,
其實可以大致推算出毒株……
比如L452R陽性+其他陰性≈Delta;
E484K陽性+N501Y陽性+其他陰性≈Beta(因為法國幾乎沒有Gamma和Mu);
N501Y陽性+P681H陽性+其他陰性≈Alpha;
等等等等。
但這位喀麥隆病人吧,
他的PCR初篩的結果特別奇葩,
居然是E484K陽性+N501Y陽性+P681H陽性,
這是之前從來沒出現過的情況~
(又是因為法國沒Gamma和Mu)
既然碰到了新鮮玩意兒,
那可必須得做測序了,
於是相關部門安排這位病例去Raoult老師他們醫院,
測完序之後發現這玩意兒造型驚人,
又順着感染鏈測了十來例,
結果擼出來了一串……
總之情況就是這麼個情況,
Raoult老師他們測完序之後,
用淺顯易懂的蹩腳法式英語把這玩意兒簡單描述了一下,
最終湊成了這篇預印本。
統共就這麼一丟丟信息量,
想犯什麼大錯誤都無從下手……
但是吧,這並不等於這玩意兒沒問題,
相反,它充滿了小問題……
或者說,充滿了私貨……
比如說:
首先,
這玩意兒的發現者,
根本就不是Raoult老師,
而是本公眾號的老朋友,
Pango team旗下頭號變異株神探,
帝國理工學院Peacock老師~
(又是這逼……)
——請品鑑啊:
↑ Peacock老師早在12月4日就提交命名申請了
然後,法國的第一例病例也並不是11月中旬出現在南法,
而是10月25日現身於法蘭西島~
(根據內線爆料,是巴黎奧利機場附近)
——請品鑑:
最後,這玩意兒的源頭更不是啥喀麥隆,
而是剛果或者剛果金二選一~
具體來說,
Peacock老師私底下一遍一遍擼演化樹,
最後擼出來的推論大概是這樣的:
鑑於B.1.640跟C.1.2(以及C.38)在刺突蛋白明顯的相似性,
又鑑於B.1.640和C.1.2都有(類似於Omicron那種)多重重組的痕跡,
然後我們已經知道C.1.2和C.38的共同祖先在剛果金,
所以B.1.640的起源地更有可能是剛果金。
——B.1.640.2和C.1.2在刺突蛋白的相似程度,請品鑑:
P9+R190+D215+Y449+E484+N501+P681+T859+D936整整九個,
其中P9、R190、Y449和D936還都是相對比較罕見的突變位點~
當然了,還有一些學術禮儀和措辭方面的小問題,
比如用了GISAID的東西去不給credit,
再比如掰着手指數缺失突變的數量卻輸錯了……
等等
但礙於篇幅,就不提了罷。
下面進入喜聞樂見的販賣焦慮環節了啊。
首先,強調一句,
鑑於Raoult老師人品堪憂,
咱就暫時不採信他們所謂的67人確診後全部入院的口徑了~
但其實吧,
除了Raoult老師的預印本之外,
法國官方也簡單提到過關於B.1.640的數據~
只不過沒嚴格區別B.1.640.1和.2而已。
(所以需要假定B.1.640家族兩個子毒株的毒力差不多)
——請品鑑:
↑ 以上是法國衛生部2021年12月15日的變異株情況例行更新
- 截止2021年12月13日,123名確診病例的完全接種率為68%;
- 同期法國完全接種率為70%……
- 123人當中有10人入院,其中兩人需機械通氣;
- 同期法國總體入院率約為2.6%左右(以入院滯後7天計);
- 上法蘭西大區某院感事件,26例感染者裡面有11例是B.1.640,其中3例死亡……
- 諾曼底某餐廳聚集性爆發事件,參與者100%接種,101人當中感染57人,入院3人……
總結總結啊,
根據上述(小樣本量)官方數據,
(重申一下,樣本量很小……)
我們可以粗略地得出以下推論:
70%的全民接種率,68%感染者接種過疫苗……這個防感染保護效力≈0;
B.1.640的CHR(確診病例入院率)比同期整體水平高了三倍出頭;
某院感事件的病死率3/11≈27%;
某聚集性感染罹患率57/101≈56%;(100%完全接種)
上述聚集性感染的CHR≈5.3%(100%完全接種)
總結完畢,
順便重複第三遍:
以上樣本量太小,
且口算很糙,
還沒能排除混雜因素……
所以上述數據給各位做個參考還行,
但可能經不起細究~
請各位考據黨手下留情……
另一個問題在於,
在這貨的重災區,
也就是這篇預印本所說的普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,
存在一些細微的異常~
——比如說,請先品鑑:
↑ 上面左圖是全法國的新增確診人數,
右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的新增確診人數。
兩邊幾乎一毛一樣。
——可是呢,請繼續品鑑:
↑ 上面左圖是全法國的入院人數,
右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的入院人數,
明顯右邊要更抖一丟丟……
而且這一點似乎沒法用接種率的細微差異來解釋~
(法國全國成人接種率91%這樣,普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區則是86%左右)
——還沒完呢,請再品鑑:
↑ 上面左圖是全法國的危重病例,
右圖是普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區的危重病例。
——最後,死亡人數:
所以到底是為了啥呢?
然後,更值得焦慮之處,
也許是這貨的傳播速度~
話說現如今大伙兒可能被Omicron抬高了焦慮門檻~
但其實就在短短兩三個月之前,
某個變異株值不值得關注,
唯一的判定標準就是它能不能不被Delta干滅絕……
而B.1.640是當初唯二能頂着Delta霸榜的巨大優勢實現逆勢增長的怪物……
(另一個怪物則是跟B.1.640長相差不多的C.1.2)
——請品鑑:
↑ 在普羅旺斯-阿爾卑斯-蔚藍海岸大區,B.1.640相對於全局的相對增長優勢高達34%。
而就算Omicron開始在法國急速飆升之後,
B.1.640居然還沒被擠掉……
——請再品鑑:
↑ 紫色的曲線就是正在暗搓搓刷市占率的B.1.640家族~
最後總結一嘴吧。
B.1.640從誕生開始,就被ECDC、UKHSA和WHO選入VUM(監視中的變異株)清單,
這顯然不是沒原因的……
這貨在傳播效率和免疫逃逸方面可能不如Omicron,
但也已經初步展示出足以推翻Delta的實力了~
所以啊,
哪怕Omicron沒有出現,
Delta似乎還是沒法永遠一桶漿糊~
攤手~
又及,說起來,
廣袤非洲真是充滿了無限可能啊……