拍照稀爛的焦慮怪 - [變異毒株]2021年12月7日，Omicron最新情況匯總－鑽石舞台

哈嘍大家好啊。

咱得先自吹自擂一把。

話說，昨天，咱又搶跑成功了。

——請品鑑：

昨天例行更新的最後一部分，

咱提到了Omicron神秘的叔叔輩已經在土澳和加拿大冒頭。

（請見這裡：[變異毒株]2021年12月6日，Omicron最新情況匯總）

就在一個小時以前，

Omicron的分類命名發生了重大調整。

B.1.1.529這個Pango編號整個被取消掉，

原先的B.1.1.529被重新命名為BA.1；

昨天提到那個神秘長輩則被命名為BA.2。

——請品鑑：

媽耶~

所以Omicron這開局陣仗真是豪華啊，

一上來就是雙毒株平行流行的節奏可還行？

今天的第二個爆炸消息，

是下面這篇神速見刊的（垃圾）論文~

——請品鑑：

簡單來說，

這幾位作者拿AlphaFold2去預測Omicron刺突蛋白RBD結構域和中和抗體結合的結構以及相互作用，

然後得出了樂觀的結論——Omicron的RBD結構雖然發生了一定變化，

但不會帶來足以完全逃逸中和抗體（以及現有疫苗保護）的超能力。

驚不驚喜意不意外？

可惜，剛剛發出來，

就被西奈山研究所巨咖Florian Krammer老師直接指着臉放嘲諷~

——請品鑑：

Krammer老師：

這玩意兒正好可以用來校驗AlphaFold2靠不靠譜啊可以說~

我覺着這個預測完全不着調……

更狠的是哈金森研究所大佬Jesse Bloom老師，

扔數據打臉可還行……

或者更具體地說，

Bloom老師放出了針對原始株的多克隆抗體（polyclonal antibody）對Omicron的中和免疫效力計算結果。

——先插播個名詞解釋：

各位，這個名詞解釋咱只能點到為止了啊，

剩下的各位自行腦補或者搜索吧。

因為如果說得太明白的話，

某些煞筆也許會誣賴咱是anti-vaxxer~

（這樣的悲劇已經發生過……）

這口大鍋咱可背不動

——總之，Bloom老師的計算結果請品鑑：

↑ 簡而言之，這張圖是感染原始株後產生的多克隆抗體，對各個變異株的中和免疫效果，

衡量單位是效果下降倍數（fold reduction）。

當然了，以上只是Bloom老師用深度突變掃描（deep mutational screening）算出來的數據，

還沒有經過試驗驗證~

（估計試驗結果最快兩周左右可以出來）

但是，Bloom老師為了驗證有效性，

還順手用這玩意兒計算了之前各大VOC的免疫逃逸能力，

結果跟相應的抗體中和測定試驗基本一致。

順便一提，圖上那個免疫逃逸能力比Omicron還猛的變態玩意兒PMS20，

那個是洛克菲勒大學大佬Theodora Hatziioannou老師他們，

在實驗室里搞出來的玩意兒，

目的為了驗證各種單抗和多抗中和效力的終極polymutant……

——這貨長這樣（可能需要點開大圖）：

是不是跟Omicron的刺突蛋白還挺像的。

然後呢，PMS20是正兒八經做過抗體中和測定的，

多克隆抗體對這貨的中和免疫效力要縮水20-80倍左右（~20 to 80-fold reduction in neutralization），

所以Bloom老是藉此推測，

多克隆抗體對Omicron的中和免疫效果要縮水25-60倍的樣子。

攤手~

哦對了，諷刺之處就在於，

洛克菲勒大學這個多克隆抗體中和免疫效果研究還挺新鮮，

兩個多月之前才在Nature上線，

——請品鑑：

現在看來，

這篇文章從標題到結論都是碩大無比的flag~

標題：

「High genetic barrier to SARS-CoV-2 polyclonal neutralizing antibodyescape」（新冠病毒多克隆中和抗體免疫逃逸的高遺傳學屏障）

結論：

「Thus, optimally elicited human polyclonal antibodies against SARS-CoV-2 should be resilient to substantial future SARS-CoV-2 variation and may confer protection against potential future sarbecovirus pandemics.」（因此，針對新冠病毒優化誘導的人體分泌多克隆抗體應該足以應對將來可能發生的大量突變，並且對未來可能發生的潛在冠狀病毒Sarbecovirus亞屬大流行提供保護）

結果話音未落，

Omicron就橫空出世……

果然是，

新冠爸爸專治各種不服